新型lncRNA MANTIS通过表观遗传调控促进内皮细胞血管生成
栏目:最新研究动态 发布时间:2017-08-03
长链非编码RNA(lncRNA)可在表观遗传水平、转录水平和转录后水平调控编码基因的表达,从而控制不同的生物过程。目前对lncRNA在表观遗传水平上的调控机制了解甚少。

长链非编码RNA(lncRNA)可在表观遗传水平、转录水平和转录后水平调控编码基因的表达,从而控制不同的生物过程。目前对lncRNA在表观遗传水平上的调控机制了解甚少。近期,德国歌德大学医学系的Ralf P. Brandes团队发现了新型lncRNA MANTIS,并描述它在表观遗传学调控中的作用。相关研究结果以“Long Noncoding RNA MANTIS FacilitatesEndothelial Angiogenic Function”为题发表在Circulation杂志上,杂志影响因子19.3。

背景 :内皮细胞的血管生成功能受到许多机制的调控,但长链非编码RNA(lncRNA)对血管内皮细胞的影响几乎没有被研究。研究人员着手鉴定新型和功能重要的内皮细胞lncRNAs。

材料 :人脐静脉内皮细胞(HUVEC)和其他细胞,血管高压病人和健康肺组织,胶质母细胞瘤和健康人脑周围组织内皮细胞,猕猴血管,小鼠和大鼠动物模型。

方法 :LNA-GapmeRs, siRNAs 或 CRISPR/Cas9敲除;Affymetrix Exon-Array;Illumina BeadChip Array;RNA原位杂交;RNA Pulldown;荧光素酶报告基因实验;免疫沉淀;质谱;RNA-seq;转座酶无障碍染色质测序(ATAC-Seq)和染色质免疫沉淀。

结果 :发现新型lncRNAMANTIS在特发性肺动脉高压(IPAH)患者中下调,它与SWG / SNF染色质重塑复合物的催化亚基BRG1相互作用,维持持BRG1活性的ATP酶功能,调控核小体重塑。因此,MANTIS通过确保有效的RNA聚合酶II机械结合,调控血管内皮关键基因的转录。

研究思路:

1. 筛选和鉴定内皮血管生成相关 lncRNA
H3K4组蛋白脱甲基酶(JARID1B)已被证明通过限制基因阻遏蛋白的表达来维持正常的内皮基因表达,作者在静脉内皮细胞(HUVEC)中敲除JARID1B,利用外显子芯片筛选血管内皮相关lncRNA。


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