只做piRNA测序!轻松搞定5分文章
栏目:最新研究动态 发布时间:2017-08-03
Piwi-interacting RNAs (piRNAs)是一类 26 到 32 nt 的非编码小RNA,在维持生殖细胞系上发挥重要作用……

目的:利用piRNA测序筛选新型乳腺癌预后生物标记物

Piwi-interacting RNAs (piRNAs)是一类 26 到 32 nt 的非编码小RNA,在维持生殖细胞系上发挥重要作用,目前还认为其在体细胞中对基因表达起到转录后调控的作用。Piwi蛋白是piRNA生物合成和作用途径的中心,对基因的表达起表观调控作用。piRNAs/PIWIs已被报道可作为多种癌症的潜在生物标记物,但其在乳腺癌中的作用尚未得到全面的研究。

研究者分别对来自104个病人的石蜡包埋乳腺肿瘤组织和11个冻存正常乳腺组织进行小RNA测序。结果正常组织获得10M reads数,肿瘤组织获得165M reads数,piRNA序列总数4,207,022条,被注释到676个piRNA上。发现25个差异表达的piRNA,包括17个上调和8个下调piNRA。

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