急性骨髓性白血病患者的单细胞的大规模平行数字转录组分析
栏目:最新研究动态 发布时间:2017-11-14
基于GemCode技术和液滴方法,Fred Hutch团队和10X Genomics 利用微流体平台......

急性骨髓性白血病患者的单细胞的大规模平行数字转录组分析

DOI: 10.1038/ncomms14049

参考文献: Zheng G X Y, Terry J M, Belgrader P, et al. Massively parallel digital transcriptional profiling of single cells[J]. bioRxiv, 2016: 065912.

基于 GemCode 技术和液滴方法, Fred Hutch 团队和 10X Genomics 利用微流体平台,提高单细胞转录组测序的效率。这种技术将带有条形码、索引分子、引物和其他凝胶珠与单细胞混合,油滴封闭 6 分钟,约 50% 的细胞捕获效率。每个液滴内发生逆转录反应,以便于获得测序所需的带有条形码的 cDNA, 能够计算每个样品中所有捕获单细胞的 mRNA 表达。

单细胞转录组的研究有利于研究人员了解复杂的生物系统。 10X Genomics Fred Hutchinson 癌症研究中心的研究人员选取了 29 例样本,检测了 250000 个单细胞转录组。利用细胞系和合成 RNA 检测单细胞测序系统的敏感性和发现稀有群体的能力;利用 68000 个外周血单核细胞系统区分了免疫群体;结合单细胞转录组测序数据的序列突变,检测器官移植病人的骨髓单核细胞在宿主与供体细胞的嵌合情况。

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