DNA甲基化测序RRBS

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简介: DNA甲基化测序RRBS是一种准确、高效、经济的DNA甲基化研究方法,通过酶切富集启动子及CpG岛区域,并进行Bisulfite测序,同时实现DNA甲基化状态检测的高分辨率和测序数据的高利用率。
提供商: 上海英拜生物科技有限公司
服务名称: DNA甲基化测序RRBS
Reduced Representation Bisulfite Sequencing(RRBS)是一种准确、高效、经济的DNA甲基化研究方法,通过酶切富集启动子及CpG岛区域,并进行Bisulfite测序,同时实现DNA甲基化状态检测的高分辨率和测序数据的高利用率。DNA甲基化研究一直是疾病研究的热点,与基因表达、表型性状息息相关。RRBS作为一种高性价比的甲基化研究方法,在大规模临床样本的研究中具有广泛的应用前景。
技术优势
·         精确度高:在其覆盖范围内可达到单碱基分辨率;
·         重复性好:多样本的覆盖区域重复性可达到85%-95%,适用于多样本间的差异分析;
·         检测范围广:覆盖全基因组范围内超过5百万个CpG位点;
·         性价比高:测序区域更有针对性,数据利用率更高。
研究结果充分证明了RRBS技术的可靠性。RRBS可作为一种更高效经济的研究方法,可应用于检测全基因组启动子和CpG岛区域DNA甲基化状态。

分析内容
1. 数据产出统计:对测序结果进行图像识别、去污染、去接头,统计结果包括read长度、read数据、数据产量;
2. RRBS序列与参考序列的比对;
3. Promoter和CpG岛(CGI)覆盖度分析;
4. Promoter和CGI区甲基化分析;
5. 差异性甲基化区域(DMR)分析。
参考文献
[1] Wang L, Sun J, Wu H, et al. Systematic assessment of reduced representation bisulfite sequencing to human blood samples: A promising method for large-sample-scale epigenomic studies. J Biotechnol. 2012.
[2] Li S, chowdhry, Liu F et al.  Tumor-Suppressive miR148a Is Silenced by CpG Island Hypermethylation in IDH1 -Mutant Gliomas. Clin Cancer Res. 2014.
[3] Terragni J, Zhang G, Sun Z, et al. Notch signaling genes: myogenic DNA hypomethylation and 5-hydroxymethylcytosine. Epigenetics, 2014.

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