microRNA靶基因分析

microRNA靶基因分析
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mciroRNA靶基因分析
1.通过TargetScan, Mirbase, Miranda预测microRNA靶基因。
2.三个软件预测的前200个靶基因,两两之间取交集选取共同靶基因。
3.每个软件前50个靶基因与另外两个软件预测的所有靶基因相比,选取共同靶基因。
4.三个软件预测的前10个靶基因,如不在基因列表之内的,则加入列表中。
5.根据第4步得到的靶基因进行显著性GO功能集分析和显著性Pathway分析,将GO和Pathway所包含的靶基因取交集。

6.所得靶基因根据三个软件总得分排序(各自得分做标准化相加)。




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